Die Geschichte des Opernchores begann offiziell 1898, als der Chor des Stadttheaters – wie ein Jahr zuvor das Orchester – in städtische Dienste übernommen wurde. Die Wurzeln des Chores reichen jedoch weiter zurück: Seit der Eröffnung des Magdeburger Nationaltheaters 1796 verfügte das Haus über einen Berufschor, der auch bei Uraufführungen wie Richard Wagners Das Liebesverbot und Albert Lortzings Undine auf der Bühne stand. Entsprechend der politischen Umwälzungen und der wechselnden Finanzierung des Theaters variierte seine Mitgliederzahl jedoch stark. Mit dem Theaterneubau 1876 wurde auch der Chor aufgestockt, was nach und nach die Erarbeitung groß angelegter Mozart- und Wagnerzyklen (1890, 1901, 1913) ermöglichte, die bis heute das Kernrepertoire des Chores bilden.
Anlässlich der Deutschen Theaterausstellung in Magdeburg präsentierten 1927 alle wichtigen Chöre der Stadt, angeführt vom Opernchor, Mahlers Sinfonie der Tausend unter dem Dirigat von Walter Beck. Zur Bundesgartenschau 1999 konnte dieser Höhepunkt der Chorsinfonik unter Christian Ehwald erneut aufgeführt werden. Seit 2006 steht der Chor unter der Leitung von Martin Wagner und konnte in großen Choropern wie Nabucco, Boris Godunow, Turandot, Lohengrin, Aida, Otello sowie in der Deutschen Erstaufführung von Zdeněk Fibichs Die Braut von Messina, in Gottfried von Einems Dantons Tod und zuletzt in einer konzertanten Aufführung von Borodins Fürst Igor des Anhaltischen Theaters Dessau überregionale Aufmerksamkeit erzielen. Neben seinen Aufgaben im Musiktheater präsentiert sich der Opernchor regelmäßig mit Oratorien und chorsinfonischer Literatur sowie bei der traditionellen jährlichen Aufführung von Beethovens 9. Sinfonie.